高中生物第2节 基因工程的基本操作程序图文课件ppt
展开DNA片段的扩增及电泳鉴定
1.利用PCR在体外进行DNA片段扩增的原理:
(1)PCR利用了 原理,通过调节 来控制DNA双链的 ,PCR仪实质上就是一台能够自动调控温度的仪器。(2)PCR扩增DNA片段还利用了 的原理。一次PCR一般要经历 次循环。
2.DNA片段电泳鉴定的原理:
(1)带电粒子:DNA分子具有___________,在一定的pH下,这些基团可以带上____________。(2)迁移动力与方向:在____的作用下,这些带电分子会向着与它所带电荷_____的电极移动,这个过程就是_____。(3)迁移速度:PCR的产物一般通过 来鉴定。在凝胶中DNA分子的迁移速率与_________、_____________和____等有关。(4)检测:凝胶中的DNA分子通过_____,可以在波长为______的_______下被检测出来。
(1)凝胶浓度:制成的琼脂糖凝胶是一种带孔的筛网状多聚物。凝胶浓度越小,筛孔越大,DNA分子迁移速率就越高;凝胶浓度越大,筛孔越小,DNA分子迁移速率就越低。
影响DNA迁移速率的因素
(2)DNA分子的大小:当凝胶浓度相同时,较大的DNA分子因体积大,所占据的空间大,在穿过凝胶孔隙时会遇到较大的阻力,穿过孔隙相对困难,迁移速率低。反之,迁移速率就高。因此,电泳一段时间后,较大的DNA分子迁移距离小,离加样孔近;而较小的DNA分子迁移距离大, 离加样孔远。相同大小的DNA分子则会聚集在凝胶同一特定的位置上。根据这一特性,可以把不同大小的DNA分子分离开来。
(3)DNA的构象:迁移速率:双螺旋环状DNA>双螺旋链状DNA>单链DNA。
(1)PCR仪(自动控温,实现DNA的扩增)(2)微量离心管(实际上是进行PCR反应的场所)(3)微量移液器(用于向微量离心管转移PCR配方中的液体)(4)一次性吸液枪头(微量移液器吸取一种试剂更换一次枪头)(5)电泳装置(包括电泳仪、电泳槽等)
(1)4种脱氧核苷酸等量混合液、2种引物、TaqDNA聚合酶、模板DNA、扩增缓冲液、无菌水。
为保证加入反应体系中的各试剂体积的准确性,建议按照加入体积的大小,由大到小依次加入各试剂,即先加入无菌水。为保护酶的活性,一般最后加入DNA聚合酶。
(2)电泳缓冲液(TAE或TBE)、凝胶载样缓冲液(内含指示剂——溴酚蓝)、琼脂糖和核酸染料(常用核酸染料为EB即溴化乙锭)等。具体内容见P117。
EB可插入DNA双链碱基之间,形成EB-DNA复合物。该复合物在紫外线激发下,发射出红橙色荧光。EB-DNA复合物荧光强度与DNA含量成正相关,根据荧光强度可粗略地估计样品中DNA含量。(EB有剧毒)
DNA分子可发生两性解离,其等电点为pH2-2.5,当电泳缓冲液pH大于其等电点时,DNA分子带负电,当电泳缓冲液的pH小于其等电点时,DNA分子带正电。在常规的电泳缓冲液中(pH约8.5),核酸分子带负电荷,在电场中向正极移动。
1.DNA片段的扩增过程
用 按照PCR反应体系配方或PCR试剂盒的说明书,在 _ 中依次加入各组分。
待所有组分都加入后,盖严离心管的盖子,将微量离心管放入离心机里,离心约 ,使反应液集中在离心管的 (提高反应速率)。
参照下表的参数,设置好 的循环程序。将装有反应液的微量离心管放入PCR仪中进行反应。
可根据目的片段长度适当调整延伸时间。
使DNA充分变性,以利于引物更好地和模板结合。
应采取旋转安装法,用力不能过猛。
先向下按压推动杆至第一停点,然后将吸液枪头垂直侵入液面,再平稳松开。
将吸液枪头紧贴容器壁,先向下按压推动杆至第一停点,稍作停顿后再按至第二停点,确保吸液枪头内没有液体残留。
2.PCR扩增产物电泳鉴定的过程
根据待分离DNA片段的大小,用电泳缓冲液配制琼脂糖溶液,一般配制质量体积为0.8%~1.2%的琼脂糖溶液。在沸水浴或微波炉内加热至琼脂糖熔化。稍冷却后,加入适量的核酸染料混匀。
将温热的琼脂糖溶液迅速倒入模具,并插入合适大小的梳子,以形成加样孔。待凝胶溶液完全凝固,小心拔出梳子,取出凝胶放入电泳槽内。将电泳缓冲液加入电泳槽中,电泳缓冲液没过凝胶1mm为宜
将扩增得到的PCR产物与凝胶载样缓冲液(内含指示剂)混合,再用微量移液器将混合液缓慢注入凝胶的加样孔内。留一个加样孔加入指示分子大小的标准参照物
接通电源,根据电泳槽阳极至阴极之间的距离来设定电压,一般为1~5V/cm。待指示剂前沿迁移接近凝胶边缘时,停止电泳
取出凝胶置于紫外灯下观察和照相
留一个加样孔加入指示分子大小的标准参照物
1.为避免外源DNA等因素的污染,PCR实验中使用的微量离心管、枪头和蒸馏水等在使用前必须进行高压灭菌处理。2.该实验所需材料可以直接从公司购买,缓冲液和酶应分装成小份,并在-20℃储存。使用前,将所需试剂从冰箱拿出,放在冰块上缓慢融化。3.在向微量离心管中添加反应组分时,每吸取一种试剂后,移液器上的枪头都必须更换。4.在进行操作时,一定要戴好一次性手套。5.PCR扩增不能随意加大试剂用量。
1.你是否成功扩增出DNA片段?判断的依据是什么?
以在紫外灯下直接观察到DNA条带的分布及粗细程度来评价扩增的结果。进行电泳鉴定的结果应该是一条条带。
该片段大小约为750bp。
2.你进行电泳鉴定的结果是几条条带?如果不止一条条带,请分析产生这个结果的可能原因。
未出现扩增条带可能的原因有:①TaqDNA聚合酶失活;②引物出现质量问题;③变性时温度低,变性时间短④Mg2+浓度过低
出现非特异性扩增带可能的原因有:①引物特异性不强或容易聚合成二聚体②复性时的温度过低③DNA聚合酶的浓度过高④模板DNA出现污染⑤Mg2+浓度过高
无关DNA:不包含目的序列,它和模板DNA在长度、浓度等方面均相近。
模板DNA:用于PCR扩增的DNA
目的DNA:已知的包含目的序列的片段,可以是重组DNA、基因组DNA等,目的DNA的浓度应与模板DNA的浓度相近。
阳性对照:用于检测PCR扩增效率
阴性对照:用于检测是否存在含有目的序列的DNA的污染。
凝胶载样缓冲液溴酚蓝和二甲苯青FF是两种在电场中以预知速率向正极泳动的染料。溴酚蓝呈现蓝紫色,与长300bp的双链线状DNA的迁移速度相同,而二甲苯青FF呈现蓝色,与长4kb的双链线状DNA的迁移速度相同。这两种指示剂能够分别显示300bpDNA和4kbDNA的电泳进程,指示终止电泳的时间。在电泳时,当溴酚蓝染料移动到距凝胶前沿1~2cm处,要停止电泳。染料的另一个作用是使样本呈现颜色,完成加样的加样孔呈现 蓝色,未加样的加样孔为无色,从而使加样操作更加便利。 样品密度较小,容易流人附近加样孔,会造成交叉污染,影响结果的分析。缓冲液中含有的甘油或蔗糖成分能够增加样品密度,保证每个样品更 容易沉入各自的加样孔,防止飘散进人其他加样孔。
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